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事業單位編制分為四種，分別是：全額撥款事業編、差額撥款事業編、自收自支事業編、參公事業編。
一、全額撥款事業編
這類事業單位是全供事業單位，也就是全額預算管理的事業單位，是其所需的事業經費全部由國家預算撥款的一種管理形式。這種管理形式，一般適用于沒有收入或收入不穩定的事業單位，如學校、科研單位、衛生防疫、工商管理等事業單位，即人員費用、公用費用都要由國家財政提供。采用這種管理形式，有利于國家對事業單位的收入進行全面的管理和監督，同時，也使事業單位的經費得到充分的保證。
二、差額撥款事業編
財政核撥補助，即財政核補，也就是差額撥款事業單位，一般包括醫院等有收入的又承擔政府社會職能的單位。
三、自收自支事業編
是國家不撥款的事業單位。自收自支管理的事業單位，現在很少了，主要是一些原來國有企業的行業主管局，現在企業大部分改制了，他們的職能淡化了，但是他們的人還屬于事業編制。
四、參公事業編
參公事業單位作為一種特殊的事業單位，具有一定的特點，主要表現為其與行政機關和一般事業單位的區別和聯系。對于參公事業單位和行政機關來說，二者編制管理不同，但是實行相同的人事管理制度，即公務員制度。參照公務員管理事業單位的工作人員其編制仍然在事業編制序列，然而卻按照公務員管理辦法進行管理。
